1513年，葡萄牙人马斯克林在前往印度时，途径印度洋一群岛，遂将其以自己的名字命名其为马斯克林群岛，波旁岛、毛里求斯岛就是该群岛中最为主要的几座小岛。
不过，葡萄牙人匆匆而过，并为对这片群岛留下太多关注，依旧让它们安静地沉睡于大洋之中。
之后，荷兰人循着葡萄牙人的足迹，也来到了富庶的东方，寻找香料的源头。他们在1598年，进驻了马斯克林群岛中的“蝙蝠岛”，并以王子莫里斯之名命为毛里求斯。
荷兰人占领毛里求斯岛以后不久，法国也开始觊觎这片岛屿。17世纪初，法国对东方的贸易额日益增大，为了与其他欧洲国家竞争，法国试图在绕经好望角的航线附近开辟一块向东方扩张的根据地。
1602年，法国便有零星殖民者登陆距毛里求斯岛仅一百六十多公里的马斯克林群岛中的另一个大岛，作为往来东方的临时补给点。到了1642年，法国人正式在该岛建立殖民机构，将其纳入到法国东印度公司旗下，为了庆贺波旁王朝又得到一块肥沃的土地，法国殖民者遂将该岛命名为波旁岛。
1660年，随着荷属开普敦和齐属昌宁殖民领地的实力日益壮大，受到刺激的法国人向波旁岛运去了第一批正式移民，以后岛上的移民不断增加。至去年为止，波旁岛上的法国移民数量已达八百多人，分别在岛屿的南北两端各自建了一座堡垒，使得整座波旁岛成为法国向印度洋地区“探索”的一个重要基地。
波旁岛殖民地在建立初期遇到了一系列困难。
首先，就是海盗的侵扰。印度洋上的海盗主要来自加勒比海安的列斯群岛，17世纪末，这些海盗为了逃避英西法等国海军的打击，将巢穴搬到了马达加斯加。从此，马斯克林群岛便成为海盗经常光顾的地方，岛上的一些土著居民也暗地里与海盗来往，海盗活动极为猖獗。
不过，随着齐国海上力量的日益崛起，这些海盗的活动空间和劫掠频率遭到极大压制。
上个世纪七十年代，齐国先后占据了银月岛（今大科摩罗岛）、望乡岛（今毛里求斯罗德里格斯岛）以及马达加斯岛西海岸后，在该地区入驻了一支西印度洋分舰队，不断在该海域执行武装巡逻和打击海盗的行动，并陆续端掉了海盗位于马达加斯岛东海岸和圣玛丽岛几处巢穴，使得猖獗一时的南印度洋海盗活动就此销声匿迹，彻底恢复了该海域的正常航行安全。
而波旁岛殖民地遇到的另一个困难是，最初很长一段时间内岛上的法国移民没有找到适宜在岛上生长的农作物。
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