这种方法是简单,运算量小,但相对的应用也比较狭窄,比如一个新发现的病毒蛋白,它的预测准确性就有点不够看了。
金毛是基于机器学习的方法预测的,大概就和大数据一样,让AI大量的学习,然后对蛋白进行预测。
这种方法是运算量大,应用面也比较宽,但同样就是只能重复,而不能创新。
德毛他们是用基于物理原理的方法去预测的,大概就是划定一个蛋白的定义,然后去预测,这种方法适用面宽,但准确性反而是不行的。
而曾女士和考神看上的这个团队,则是用从头算方法搞蛋白结构预测。
这种方法,早期来看,尼玛没有任何的优点,全是缺点。
首先运算量巨大,比如进行分子动力学模拟时,为了获得较为准确的结果,需要很小的时间步长(飞秒级),并且模拟时间尺度要足够长。
这就需要大量的计算资源,包括高性能的计算机集群甚至超级计算机。
这些还是一个必须条件,这玩意不光要数学家,还要精通力学的物理学家。分子和分子之间是有力的,因为力的不同,就会造成力场的不准确性。
然后力场不同在构象搜索过程中可能会出现问题。
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