NERV总部是完全建立在地下黑月撞击时形成的天然空腔中，而在总部一直向下，也有着各种机构在运作，直到最下方保存莉莉丝的最终教条区！
“这里本是当初坠落的黑月位置，而莉莉丝则是我们这个世界人类的起源，第二使徒。”
碇源堂亲自带着陶玉下来，旁边还跟着冬月。
一路上也在为陶玉解释着莉莉丝的大概存在意义。
随着电梯的抵达，在旁边LCL溶液形成的水面中央，半截白色的怪异人影被钉在了一处十字架上。
在这白色的怪异人影身上，有着一张紫色的脸庞，脸上左四右三有着七枚眼睛。
下半身消失不见的巨型怪人缺口处，好似根须一样向外生长着什么，而一柄血色的长枪，此时正贯穿了怪人的胸口，将其钉在了十字架上！
“初号机就是用祂的身躯制造的，人类也是由祂诞生，现在拔出朗基努斯之枪，莉莉丝便也会拥有着使徒的恢复能力，甚至不排除让人类重新‘恢复’的可能……”
碇源堂轻描淡写的说着一些可怕的事情。
“嗯，很动听的故事。”
陶玉看着眼前那半截莉莉丝的身躯，眼神也越来越亮。
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