琴酒的本意，是用毒药来杀人灭口。
谁知他走后，那颗药作用在工藤新一身上，却没能把这个头铁的侦探毒死，只是把他缩水成了一个小学生。
缩水版工藤新一醒后逃回家，在阿笠博士的提议下，化名“江户川柯南”，去了毛利家借住。
……倒不全是因为他喜欢跟毛利兰同居，主要是毛利兰的父亲毛利小五郎，开了一家侦探事务所。
而按照阿笠博士的脑回路，缩水版工藤新一需要：
用他出色的推理才能，帮毛利小五郎成为名侦探↓
名侦探毛利小五郎参与高等案件↓
通过那些案件，接触到给工藤新一灌药的黑衣组织↓
从黑衣人那里拿到变小毒药的样本↓
黑科技大佬阿笠博士研制出解药↓
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