同样五军营的编制也是暂时的，杨正山以后还打算扩编。
水师营由余通海负责统领，乌重辙和薛平负责协助。
五军营，谢渊兼任后军营把总，宋大山兼任中军营把总，杨明志兼任前军营把总，洛飞羽和杨明镇分别兼任左右两军营的把总。
另外设立亲兵营，将原本在衙门内充当文吏的将士抽调出来，单独组建亲兵营，由杨明浩充任亲兵营把总。
韩飞升任卫司衙门镇抚司镇抚，周仁升任经历司经历，陆文华升任知事司总知事，另选六位文吏提拔为知事，各自负责两到三个房科。
卫司衙门的职位调整了一下，架构相对也出现了一些变化。
之所以要如此做，一是因为腾龙前卫独立出去了，卫司衙门肯定要做出一些调整，二是因为卫所和五军营之间的平衡，杨正山不希望五军营与卫所分割的太明确，否则可能会让手底下的人感到不满。
就如谢渊，他之前主要负责卫所的屯堡和建设，几乎不插手兵丁和营兵选拔的事情。
若是以后五军营需要上战场，那谢渊是不是就不用去了？
不去战场如何立功？
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